甘肅民族出版社成立于1957年，1979年因甘肅省阿拉善右旗和額濟納旗兩個蒙古族自治地區劃歸內蒙古自治區，甘肅民族出版社不再出版蒙文圖書。1990年起，成為甘肅人民出版社領導下的縣級專業出版社。自2009年12月24日，隸屬于讀者出版傳媒股份有限公司。

出版文種為藏文和漢文。每年出版藏漢文圖書約50余種，其中藏文圖書占總出書量的40%。甘肅民族出版社在全國三十多家民族出版社當中，是少數沒有國家財政撥款的出版社之一，自己養活自己，以出漢文圖書補貼藏文圖書。出版的藏漢文圖書每年均有10種左右獲國家、省級優秀圖書獎。以編譯出版藏文圖書為主，1979年前曾兼出版蒙文圖書。出版有《藏漢詞典》、《安多政教史》等藏文書籍。

2012年以來，經甘肅省新聞出版廣電局審核上報，甘肅民族出版社有2個項目獲得國家出版基金項目的資金支持，資助經費60萬元。甘肅民族出版社在國家出版基金項目的帶動下，出版社的選題策劃加強了，財務管理規范了，出版的質量意識進一步加強。

2013年11月，獨立為甘肅民族出版社有限責任公司，具有獨立法人資格。